Installationsanleitung: GROMACS

Installationsanleitung: GROMACS#

1. Vorbereitung: Windows Subsystem for Linux (WSL) und Ubuntu installieren#

  1. WSL aktivieren

    • Öffnen Sie die Windows-Kommandozeile (cmd) oder PowerShell und geben Sie ein:

      wsl --install

    • Bei Windows 11 ist WSL bereits vorinstalliert. Falls nicht, folgen Sie den Anweisungen zur Installation.

    • Nach der Installation muss der Rechner neu gestartet werden.

  2. Windows-Feature aktivieren

    • Suchen Sie in der Windows-Suchleiste nach „Windows-Features aktivieren oder deaktivieren“.

    • Aktivieren Sie die Option „Windows-Subsystem für Linux“.

    • Starten Sie den Rechner erneut.

  3. Ubuntu installieren

    • Öffnen Sie den Microsoft Store und installieren Sie Ubuntu (empfohlen: Ubuntu 22.04 LTS).

    • Starten Sie Ubuntu und vergeben Sie einen Benutzernamen und ein Passwort.

    • Merken Sie sich beides, da Sie es bei Installationen benötigen.

2. GROMACS installieren#

  1. Ubuntu aktualisieren

    sudo apt update && sudo apt upgrade -y

  2. Erforderliche Pakete installieren

    sudo apt install build-essential cmake wget -y

  3. GROMACS herunterladen

    wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2025.3.tar.gz

    Mit

    ls

    können Sie prüfen, ob die Datei im aktuellen Verzeichnis liegt.

  4. Archiv entpacken mit tar

    tar xfz gromacs-2025.3.tar.gz
cd gromacs-2025.3

    Mit dem Befehl cd wechseln Sie in das entpackte Verzeichnis.

  5. Build-Ordner anlegen und betreten

    mkdir build
cd build

  6. Konfiguration der Installtion mit CMake

    cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON

  7. Kompilieren (Dieser Schritt kann einige Zeit in Anspruch nehmen)

    make -j$(nproc)

  8. Optional: Installation prüfen (Dieser Schritt kann einige Zeit in Anspruch nehmen)

    make check

  9. Installation durchführen

    sudo make install

  10. GROMACS-Befehle aktivieren

    Dieser Befehl muss immer bei Neustart der Ubuntu Umgebung unter Windows durchgeführt werden.

    source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC

3. Test der Installation#

Prüfen Sie die Installation mit:

gmx --version

Wenn die Versionsnummer von GROMACS 2025.3 erscheint, ist die Installation erfolgreich abgeschlossen.

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