1 Aufgabenstellung

• Führen Sie eine Molekulardynamik-Simulation eines RNA-Hairpins mit GROMACS durch.

• Dokumentieren Sie die einzelnen Schritte der Simulation (Energie-Minimierung, Äquilibrierung, Produktionslauf) mithilfe geeigneter Grafiken und Beschreibungen.

• Analysieren Sie die Ergebnisse der langen MD-Simulation in Hinblick auf die strukturelle Veränderung des RNA-Hairpins.